辦公室：負責全站綜合協調工作；負責綜合治理、安全生產、文明創建、文秘、檔案、圖書、計劃生育、公務接待等工作。 

人事科：人力資源管理、網絡信息管理、黨務紀檢管理等工作。

財務科：負責全站財務管理、往來結算工作；負責編制單位年度預算和決算工作。 

后勤科：負責設備、原輔材料、辦公用品的采購和保管工作；負責車輛、水、電的管理工作；負責設備、設施、車輛的維修和管理工作；負責綜治、內保、計量和血費報銷工作。

質管科：負責全站質量體系運行，文件和記錄的歸口管理與信息上報工作；負責血液及血液制品、采血環境、人員、設備、試劑與原輔材料以及關鍵設備等的質量檢測工作；負責不合格品的識別和判定，站內站外培訓、臨床用血指導及安全與衛生等工作。

檢驗科：負責血液的檢測工作；負責HIV檢測呈反應性的血液標本送檢及統計上報工作；負責參與室間質評工作；完成省臨床檢驗中心組織的標本送檢工作；負責小樣結果回訪及臨床咨詢工作。 

獻血招募辦：負責無償獻血宣傳教育、組織發動，組織血源和獻血員招募工作；負責無償獻血者的建檔工作、固定無償獻血者隊伍及志工服務隊的建設和管理工作；負責采血車組的日常管理和獻血者滿意度調查等工作。

獻血服務科：負責獻血屋的日常管理工作；負責無償獻血者的電話回訪工作。

供血服務科：負責血液的入庫、包裝、放行、發放及送血工作；負責日常臨床輸血指導工作；負責站內血費的日常收繳工作；協助用血機構滿意度調查工作。

成分制備科：負責血液成分制備工作；負責成品庫血液制品進一步加工后的成品的貼簽工作。

機采科：負責成分獻血知識的宣傳及機采血小板志愿者的招募、登記、體檢、采集和回訪等管理工作；負責站內全血的采集工作；協助后勤科做好市內血費報銷工作。 

工會辦：負責民主管理工作，維護員工合法權益。 開展職業道德和各種形式的精神文明建設，提高員工隊伍素質，切實辦好“員工之家”。